В 18 лет, не успев сдать до конца сессию за первый курс, Василий Сергеевич вступил в ряды Красной Армии и принял участие в боевых действиях на Северо-Западном, Калининском, Западном и Волховском фронтах. После тяжелого ранения продолжил учебу. Был награжден орденами Красной Звезды и Отечественной войны I степени, медалями «За оборону Москвы» и «За оборону Ленинграда».
С 1972 по 1991 год Василий Сергеевич преподавал в Ярославском государственном университете и руководил кафедрой истории СССР. За работу над многотомной историей Сибири в составе авторского коллектива удостоен Государственной премии СССР.
В 2022 году в актовом зале Ярославского государственного университета им. П.Г. Демидова состоялся памятный стол «Ровесник. Защитник, Историк СССР» в честь юбилея основателя научной исторической школы ЯрГУ. В нем участвовали студенты и преподаватели вузов, сотрудники научных учреждений Томска, Новосибирска и Ярославля.
— В настоящее время развиваем сотрудничество с проектом Российского общества «Знание» – электронной энциклопедией «Знание.Вики». Для первой статьи в проекте готовлю материалы о Василии Сергеевиче Флёрове, фронтовике и выдающемся учёном. Он всегда был и будет примером! — подчеркнула научный руководитель ОМЦ ЯрГУ Виктория Марасанова